Cenaze namazına Fenerbahçe Başkanı Ali Koç, divan kurulu başkanı Vefa Küçük, yöneticiler Volkan Ballı, Kocaeli Üniversitesi Rektörü Sadettin Hülagü, AK Parti ve CHP Kocaeli milletvekilleri, Fenerbahçe UNİFEB, Genç Fenerbahçeliler ile Galatasaray, Beşiktaş, Trabzonspor takımlarından birçok taraftarlar katıldı. Kocaeli Üniversitesi Rektörü Sadettin Hülagü, üniversite içindeki bir spor salonuna Koray Şener'in adı verileceğini söyledi. Kılınan cenaze namazının ardından Şener'in cenazesi Körfez İlimtepe Mezarlığı'nda toprağa verildi.